اشخاص خنثی یا کسانی که علائم جنسی آنها با گرایشات و تمایلات جنسیشان موافق نسیت میتوانند تقاضای تغییر نمایند. متقاضیان پس از ثبت درخواست خود در سازمان بهزیستی به دادگاه فرستاده شده و توسط پزشکی قانونی مورد بررسی قرار می گیرند و در صورتی که نیاز آنها به طور قانونی و با تشخیص پزشک و دادگاه صالح تأیید شود دادگاه بلافاصله اقدام به صدور دستورات لازم برای انجام عمل جراحی و صدور مدارک شناسایی با ذکر جنسیت جدید می نماید.
در متن قانون ایران تا کنون مقررات خاصی دربارهٔ این موضوع وضع نشده است. اما بر خلاف دیگر کشورهای اسلامی، جراحی تغییر جنسیت در ایران برای هر کسی که در مصاحبههای روانشناسی قبول شود و بتواند هزینهٔ عمل را پرداخت کند ممکن است.
مدارک و منضمات مورد نیاز جهت طرح دعوای تغییر جنسیت :
1- تصویر مصدق شناسنامه (اجباری)
2 – تصویر مصدق نظریه پزشک متخصص(اجباری)
3- به همراه داشتن كارت ملي جهت احراز هويت و كارت عابر بانك جهت پرداخت هزينه ي دادرسي الزامي است.
*در صورت عدم وجود مدارك اختياري فوق مي توانيد يكي از دلایل ذيل را ارائه نماييد.
1- استماع شهادت شهود و مطلعين. 2- تحقیقات محلی. 3- شماره پرونده استنادي. 4- استعلام نظر پزشکی قانونی. 5- ساير دلايل و منضمات